BMČ od roku 1947 zachycuje veškeré odborné písemnictví vydané na území České republiky a práce českých autorů vydané v zahraničí. Do roku 1996 byla její součástí i lékařská literatura vycházející na Slovensku.
MeSH je biomedicínský slovník vydávaný od r. 1960 U.S. National Library of Medicine s každoroční aktualizací. Aktuálně obsahuje 30 194 hesel s více než 120 000 odkazy.
NLK provozuje knihovní informační systém Medvik – Medicínská virtuální knihovna. Systém je knihovnám poskytován jako služba a je centrálně provozován v datovém centru NLK.